Das Studienangebot umfasst acht Bachelor- und neun Master-Studiengänge, drei Masterprogramme im Bereich der Advanced-Studies und mehrere Zertifikatskurse (Weiterbildung). Die Studiengänge sind in fünf Fachbereichen organisiert: Musik, Gestaltung und Kunst, Oper/Theater, Konservierung und Restaurierung sowie das Schweizerische Literaturinstitut. Das Institut für Transdisziplinarität (Y) fördert den Austausch zwischen den Fachbereichen. Jeder Fachbereich hat einen Fachbereichsleiter, eine Fachbereichsleiterin. In den Fachbereichskonferenzen sind die Studiengangsleitungen, die Dozierenden, die Assistierenden und die Studierenden vertreten.

Die Forschung an der HKB ist praxisnah und zeichnet sich durch die Verbindung von wissenschaftlichen und künstlerischen Ansätzen aus. Die HKB forscht in den vier Schwerpunkten Kommunikationsdesign, Interpretationsforschung, Intermedialität sowie Materialität in Kunst und Kultur. Der Forschungsrat koordiniert die Forschung, die Forschungsstelle ist für die Organisation zuständig.